达芬奇《最后的晚餐》第四个秘密：彼得威胁的手势

另一处奇怪的特写是，彼得的左手好像要砍向约翰(或抹大拉)的脖颈一般，一幅威胁的姿势。关于彼得，列昂纳多是不是想向我们说点什么呢?再仔细些看，离画面进一些，您就会发现，很明显那只拿着短刀的手实际上就是彼得的。虽然显得有点笨拙、不自然，但是因为他的右手手腕弯着，所以看起来不像他的。至于他的左手作出的抹约翰脖子的姿势，另外一个解释是，彼得只是想要把左手搭在对方身上而已。看起来争论还会一只继续下去。

达芬奇《最后的晚餐》第五个秘密：托马斯的一根手指

在耶稣的左手边，面对着耶稣的托马斯作出伸出一根指头的姿势，按作者的话来说，是约翰的手势引起的。再说托马斯，他举起左手的食指也作出一个威胁的姿势，也就是普林斯和皮克奈特所说的约翰的手势，据说他代表秘密的知识与智慧，认为是洗者约翰比耶稣起到了更重要的作用，而不是完全像《圣经》里讲述的那样。想了解详细地说明的人，建议您读一下《圣殿骑士启示录》。

达芬奇《最后的晚餐》第六个秘密：达芬奇的自画像

撒迪厄斯实际上是列昂纳多的自画像，他背向耶稣。撒迪厄斯确实和达芬奇的形象很接近，可以比较一下他的著名的《自画像》。列昂纳多的许多作品都牵涉耶稣或者神圣家族。画面构图中，至少有一个人背向中心人物，这是一个再次出现的问题。