山地下部为合头草、红沙半灌木荒漠，棕漠土;上部为沙生针茅、短花针茅为主的草原化荒漠，棕钙土;向上过渡为针茅、昆生葱、昆仑蒿为主的高寒荒源草原;在海拔4500米山地内部坡麓及岩屑坡上，垫状驼绒藜、糙点地梅组成稀疏的高寒荒漠;在海拔4500～5500米的下部为稀疏植被，上部为寒冻风化带，更高山峰则为冰雪带。 [5-6]

东段

东段向东略呈扇形展开，分为3支：北支祁漫塔格山，其南隔以阿牙克库木盆地，东延为唐松乌拉山、布尔汗布达山;中支阿尔格山，东延为博卡雷克塔格、唐格乌拉山与布青山，地形上与阿尼玛卿山相接;南支为构成青南高原上的主体山脉，东延与相接。昆仑山垭口是青藏公路必经之道。 [5-6]

昆仑山垭口一带的雪线高度，北坡5200米，南坡5400米。雪线附近的年均温-9～-8℃，山间谷地西大滩(4200米)一带的年均温低于-3℃，年降水量350毫米左右。山地顶部年降水量略有增加，青藏高原北坡现代多年冻土的下界在4200米左右。 [5-6]

主要河流有流入塔里木盆地中的车尔臣河;流入柴达木盆地的有那仁郭勒河、乌图美仁河、及柴达木河，前者由冰雪融水补给，属于塔里木内流水系;后四者由降水与湖水补给，属于柴达木内流水系。 [5-6]

山地北坡为荒漠化草原，在海拔3600米以下为干燥剥蚀的基岩山地，几无植物生长，沟坡及岩屑上堆散生有垫状驼绒藜，红沙、合头草荒漠;3600～3800米过渡为紫花针茅亚高山草原;3800～4500米的山地下部是以小嵩草为主的草原化高山草甸，上部为垫状植被;4500～5000米以上过渡为稀疏的高寒植丛和寒冻风化带;5500米以上为高山冰雪带。 [5-6]

地质特点

昆仑山脉与塔里木盆地和柴达木盆地间均以深大断裂相隔。昆仑山地区以前震旦系为基底;古生代时为强烈下沉的海域并伴有火山活动，古生代末期经华力西运动褶皱上升，构成昆仑中轴和山脉的中脊;中生代产生拗陷，经燕山运动构成主脊两侧4000米以上的山体。昆仑山脉与构成分隔中国南部与北部的纬向山脉。 [7]

昆仑山脉的新构造运动极其强烈，晚第三纪以来上升大约4000～5000米;叶尔羌拗陷中的砾石层厚度2500余米，河谷高阶地上则分布有第四纪火山凝灰岩和火山角砾岩;克里雅河与安迪尔河的上游均保存有中更新世玄武岩流与火山口，1951年在于田县境昆仑山中的卡尔达西火山群的一号火山曾爆发，并伴有现代火山泥石流。东部昆仑山第四纪以来上升了2800余米，其相关沉积物在柴达木盆地中的埋藏深度达2800米。昆仑山的新构造运动具间歇性，叶尔羌河、喀拉喀什河、尼雅河均形成4～5级阶地;各河出山口形成4～5级叠置的洪积扇。